Il Museo è oggi collocato in locali sottostanti il Monastero di S. Scolastica, restaurati in occasione del Giubileo del 2000, dove un tempo sorgeva un vecchio frantoio. Nel Museo sono presenti oggetti diversi riguardanti le scienze geologiche, archeologiche, paleontologiche, etnologiche e strumenti scientifico-didattici per la scuola, appartenenti alla collezione Ceselli e donati alla comunità benedettina nel secolo scorso.